PostgreSQL
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Est-il préférable d'utiliser plusieurs bases de données avec un schéma chacune ou une base de données avec plusieurs schémas ?

Un "schéma" PostgreSQL est à peu près identique à une "base de données" MySQL. Avoir de nombreuses bases de données sur une installation PostgreSQL peut devenir problématique; avoir de nombreux schémas fonctionnera sans problème. Vous voulez donc absolument utiliser une base de données et plusieurs schémas au sein de cette base de données.