Vous devez exécuter l'instruction LOAD DATA INFILE avec l'option supplémentaire
FIELDS OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'
Ainsi toute la déclaration devient
LOAD DATA INFILE '<FILENAME>' INTO TABLE <TABLENAME>
FIELDS TERMINATED BY ','
OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'
LINES TERMINATED BY '\r\n'
(col1, col2, col3, ...)
Pour plus de lectures, veuillez consulter l'excellent Manuel de référence MySQL par exemple. pour MySQL 5.1 GA.