ALTER TABLE .. peut être utilisé pour déplacer des tables d'une base de données à une autre :
alter table my_old_db.mytable rename my_new_db.mytable
Avertissement :comme vous l'avez demandé, il s'agit d'un déménagement, pas d'une copie à la nouvelle base de données !
Mais vous conserverez les données du tableau (et non les contraintes d'intégrité si elles s'appliquent dans votre cas)
Concernant php, php est capable d'exécuter des commandes sql donc ce ne sera pas un problème.
