Une exploration un peu plus poussée montre que ce qui suit fera l'affaire :
new Sequelize('mydb', undefined, undefined, {
host: '/var/run/postgresql',
dialect: 'postgres'
});
La connexion réelle est gérée par le package 'pg' et cela a été documenté dans un issue .
Remarque, j'ai testé cela pour fonctionner avec pg@6.4.1 et sequelize@4.4.2.