Comme mentionné dans les commentaires de @JuanCarlosFarah et @RobertMunn , GridFS semble être le meilleur (et peut-être le seul ?) moyen d'insérer des fichiers dans la base de données sans écrire une petite application.
mongofiles -d myMongoDB -l myFileName.ogg --type audio/ogg put "The Name of my File in the Collection"
Voir mongofiles pour plus de détails.