En Php il y a une fonction nommée nl2br
echo nl2br("hello\nWorld");
et le résultat est
hello<br/>World
En sql, il existe une fonction nommée REPLACE
UPDATE yourtable SET field=REPLACE(REPLACE(field, CHAR(13), ''), CHAR(10), '')
Et enfin en javascript vous avez replace
aussi
myString = myString.replace(/\r?\n/g, "");
Bonne chance