Solution :
Pour ceux qui ont rencontré le même problème - voici ce que j'ai trouvé. J'ai lancé show variables like 'datadir' et j'ai découvert que mes fichiers de données sont stockés dans un dossier différent :C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.5\data\
et je remplaçais initialement les fichiers dans le dossier C:\Program Files.... Il y avait aussi les fichiers nécessaires présents.
Donc finalement tout s'est bien passé.
