Mysql
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Plus rapide pour randomiser de nombreux résultats sur MySQL Server ou en PHP

Ma supposition éclairée est que MySQL gagne haut la main. Il est fait pour gérer les données de cette façon. La simple surcharge de devoir déplacer toutes les données vers PHP pour le tri lui donne un avantage au démarrage.

Vous pouvez le découvrir par vous-même en faisant une analyse comparative, bien sûr.