On dirait que vous utilisez InnoDB tables, vous devez donc également copier les fichiers ib * dans le dossier de données (mais cela écrasera toute table InnoDB créée dans la nouvelle installation.)
Alternativement (encore mieux), vous pouvez définir le paramètre 'datadir' dans le fichier de configuration et spécifier le chemin d'accès au dossier de données dans l'ancienne installation.