J'ai finalement trouvé sa solution. Enregistrez le fichier sh disponible sur https://gist.github.com/943776 et exécutez"./mysql2sqlite.sh DBNAME --databases DBNAME -u DB_USERNAME -pDB_PASSWORD | sqlite3 database.sqlite
"(sans qoutes et avec "`") dans le fichier php. Enregistrez les deux fichiers dans un dossier