La solution consiste à imbriquer ORDER BY et LIMIT dans une clause FROM dans le cadre d'une jointure. Cela vous permet de trouver d'abord la ligne exacte à mettre à jour (ta.id), puis de valider la mise à jour.
UPDATE tableA AS target
INNER JOIN (
SELECT ta.id
FROM tableA AS ta
INNER JOIN tableB AS tb ON tb.id = ta.user_id
WHERE tb.username = '$varName'
ORDER BY ta.datetime DESC
LIMIT 1) AS source ON source.id = target.id
SET col1 = '$var';
Chapeau au baron Schwartz, alias Xaprb, pour l'excellent article sur ce sujet précis :http://www.xaprb.com/blog/2006/08/10/how-to-use- order-by-and-limit-on-multi-table-updates-in-mysql/