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Comment utiliser correctement PHP pour encoder l'objet MySQL en JSON ?

$data = array();

while ( $row = $result->fetch_assoc() ){
    $data[] = json_encode($row);
}
echo json_encode( $data );

Cela devrait le faire. Vous pouvez également utiliser http://jsonlint.com/ pour voir quels sont les problèmes avec votre sortie JSON.

Mise à jour : en utilisant fetch_all() peut être une bonne idée aussi

$data = $result->fetch_all( MYSQLI_ASSOC );
echo json_encode( $data );