Il semble étrange que ce répertoire n'ait pas été créé lors de l'installation - avez-vous modifié manuellement le chemin du fichier socket dans my.cfg ?
Avez-vous simplement essayé de créer vous-même ce répertoire et de redémarrer le service ?
mkdir -p /var/run/mysqld
chown mysql:mysql /var/run/mysqld
