SQLyog
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Clé étrangère comme clé primaire

Je suggérerais quelque chose de plus dans ce sens :

table1: students
---------------------
PK id
name
number
...
---------------------

table3: classes
---------------------
pk id
name

table2: students_score
---------------------
fk student_id
fk class_id
score
PK(student_id, class_id)