Les clés étrangères dans MyISAM sont uniquement à des fins consultatives. Vous pouvez les regarder pour voir où l'intégrité référentielle serait être, s'il y en avait. Il est plus facile de comprendre le schéma de cette façon que de deviner des relations en regardant les index créés comme effet secondaire.
Je ne sais pas pourquoi il disparaîtrait dans phpMyAdmin, à moins que ce ne soit un problème de configuration (je crois que la vue peut être désactivée) ?