Il y a quelques liens Google sur ce même problème que j'ai suivis qui m'ont aidé à résoudre ce problème (j'aurais dû passer plus de temps à googler avant de poster !). Donc, pour résoudre le problème, je devais créer une base de données phpmyadmin et importer create_tables.sql et attribuer un nouvel utilisateur avec tous les privilèges, puis décommenter le fichier config.inc.php à :
/* User used to manipulate with storage */
$cfg['Servers'][$i]['controlhost'] = '';
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] = 'phpmyadmin';
et décommentez les lignes ci-dessous
/* Storage database and tables */
$cfg['Servers'][$i]['pmadb'] = 'phpmyadmin';
J'ai également dû ajouter quelques lignes de la nouvelle version config.sample.inc
Il y avait un bon lien décrivant ce que je voulais enregistrer mais j'ai dû vider le cache de mon navigateur pour recharger localhost/phpMyAdmin et ce faisant, j'ai perdu mon historique et ce lien !
Je sais que cette explication n'est pas exactement décrite, mais j'espère que cela pourra aider toute autre personne qui rencontre un problème similaire après la mise à jour de phpMyAdmin. Je ne sais toujours pas à quoi servent toutes ces fonctionnalités, mais tout est maintenant corrigé, merci !