Si j'ai bien compris votre question, vous voulez ces documents qui ont les mêmes valeurs dans le champ 1 et le champ 2.
Pour cet essai
db.coll.find({$where: function() { return this.field1 == this.field2 } } );
ou plus compact
db.coll.find({ $where : "this.field1 == this.field2" } );