J'ai eu le même problème, bien que je n'aie remarqué aucune erreur ou problème, j'ai reçu ces avertissements. Ils semblaient inoffensifs.
J'utilise MariaDB Ver 15.1 Distrib 10.3.22-MariaDB, pour debian et votre commande a parfaitement résolu le problème :
mysql_upgrade -u root -h localhost -p --verbose --force