Votre question couvre un sujet très complexe avec de nombreux problèmes qui doivent être pris en compte avant de décider d'une solution. Des facteurs tels que la quantité de données changeant par intervalle de temps, la bande passante et la latence de la connexion réseau, la fiabilité de la connexion réseau, la sécurité des données, l'authentification, l'autorisation, les procédures de sauvegarde et de récupération, le basculement et la tolérance aux pannes ne sont qu'un début.
Cet article d'Amazon traite de la réplication d'une base de données MySQL hébergée sur site vers RDS. Une friandise intéressante de cet article est :
Migrer les données MySQL sur site à Amazon RDS