Pas besoin de l'envelopper avec un autre CASE/COALESCE/IFNULL ou quoi que ce soit, utilisez simplement le CASE EXPRESSION ELSE , si toutes les conditions ne sont pas remplies, le ELSE sera utilisé.
UPDATE users
SET reputation = reputation +
CASE WHEN id = ? THEN 2
WHEN id = ? AND NOT ? THEN 15
ELSE 0
END
WHERE id IN (?, ?);