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Comment puis-je migrer des versions de bugzilla vers un nouveau champ personnalisé "version source" dans redmine (de quelle syntaxe SQL ai-je besoin) ?

Votre requête

INSERT INTO custom_values
(Issue, issues.id, 4, versions.name)
SELECT * FROM issues INNER JOIN versions ON issues.fixed_version_id=versions.id;

devrait être modifié à ceci

INSERT INTO custom_values
(customized_type, customized_id, custom_field_id, value)
SELECT 'Issue', issues.id, 4, versions.name
FROM issues INNER JOIN versions ON issues.fixed_version_id=versions.id;

afin d'être valide en SQL.

Mais je sauvegarderais quand même la base de données... :-)