UPDATE table AS t
JOIN table AS tt
ON t.initials = tt.initials
AND t.surname = tt.surname
AND t.company = tt.company
AND t.id > tt.id
SET t.active = 1;
Autrement dit, pour chaque ligne, mettez-la à jour s'il existe une autre ligne avec un identifiant inférieur, avec les mêmes initiales, nom et société.
Voici un sqlfiddle pour cela.