Pour définir la valeur de départ d'un champ d'incrémentation automatique, vous pouvez utiliser alter table
ALTER TABLE wp_postmeta AUTO_INCREMENT = 1000;
Autant que je sache, il n'est pas possible d'avoir deux champs à incrémentation automatique sur la même table dans mysql, vous devez donc le faire vous-même de manière progammatique (par exemple avec un déclencheur)