En fait, j'ai rencontré ce problème car j'ai inclus les mauvais fichiers d'en-tête dans le Makefile de mon projet.
Dans mon Makefile, j'incluais des en-têtes pour une version Solaris de MySQL, mais je compilais sous Linux. Après avoir pointé les inclusions vers les en-têtes de version MySQL corrects, je n'ai plus eu cette erreur.