J'ai finalement trouvé une solution et c'était assez simple...
Tout d'abord, je dois laisser mysql lier l'adresse externe, j'ai donc changé la ligne bind-address en '0.0.0.0' à l'intérieur du conteneur. Ensuite, j'ai juste changé la ligne de commande avec mysql -h 127.0.0.1 -P 3308 -u root -pMyPassword
Maintenant ça va, je peux accéder aux données mysql du conteneur depuis l'hôte.
Merci à tous pour votre aide :)