Il existe des versions de mysqldb pour python 2.6, elles ne sont tout simplement pas disponibles sur le site officiel. Cela m'a pris un certain temps (et malheureusement j'ai perdu le lien) mais vous pouvez rechercher sur Google et trouver des personnes qui ont compilé et publié les versions 2.6 de mysqldb pour Windows x64 et x32.
MODIFIER :
http://sourceforge.net/forum/forum.php?thread_id=3108914&forum_id =70460
http://sourceforge.net/forum/forum.php?thread_id=2316047&forum_id =70460
Ce fourm a un lien vers les versions de mysqldb pour Python 2.6
