Vous pouvez basculer la clause LIMIT ajoutée par MySQL Workbench via l'onglet SQL Editor dans les préférences de l'application (menu Edition -> Préférences...).
Décochez simplement l'option "Limiter les lignes" dans la section Résultats de la requête, comme illustré ci-dessous.
MODIF :
Dans Workbench 6.0, la case à cocher "Limiter les lignes" se trouve dans l'onglet "Requêtes SQL" (nouvel onglet du même formulaire).