Si vous êtes sur la page Présentation du modèle, vous obtenez un onglet avec le schéma. Si vous faites un clic droit sur cet onglet, vous obtenez une option pour "modifier le schéma". De là, vous pouvez renommer le schéma en ajoutant un nouveau nom, puis cliquez en dehors du champ. Cela vaut pour MySQL Workbench 5.2.30 CE
Modifier :dans la vue d'ensemble du modèle, il se trouve sous Schémas physiques
Capture d'écran :