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Quel est le meilleur codage de caractères pour la langue japonaise pour l'affichage DB, php et html ?

UTF-8 sans aucun doute. Faites tout en UTF-8. Pour mettre du texte encodé en UTF-8 sur votre page Web, utilisez ceci dans votre balise HEAD :

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" />

Comme pour MySQL, placez ce qui suit dans votre fichier my.cnf (config) :

[mysqld]
collation_server=utf8_unicode_ci
character_set_server=utf8
default-character-set=utf8
default-collation=utf8_general_ci
collation-server=utf8_general_ci

Si vous obtenez des caractères parasites de la base de données à partir de requêtes exécutées par votre application, vous devrez peut-être exécuter ces deux requêtes avant récupération de votre texte japonais :

SET NAMES utf8
SET CHARACTER SET utf8