Si les lignes sont vraiment distinctes dans chaque colonne, vous pouvez utiliser SELECT DISTINCT .
Puisque vous utilisez SQL Server, vous pouvez également utiliser row_number() pour renvoyer une ligne pour chaque ThreatId :
select ThreatId,
ThreatTopClient,
...
from
(
select ThreatId,
ThreatTopClient,
...,
row_number() over(partition by ThreatId order by ThreatMLSeq) rn
from xThreatCA
where ThreatMLSeq <> N''
and ID <> 0
) d
where rn = 1
order by ThreatMLSeq