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Comment générer un schéma à partir d'un CSV pour une copie PostgreSQL

Si le CSV n'est pas excessivement volumineux et disponible sur votre machine locale, alors csvkit est la solution la plus simple. Il contient également un certain nombre d'autres utilitaires pour travailler avec les CSV, c'est donc un outil utile à savoir en général.

À sa plus simple saisie dans le shell :

$ csvsql myfile.csv

imprimera le CREATE TABLE requis Commande SQL, qui peut être enregistrée dans un fichier à l'aide de la redirection de sortie.

Si vous fournissez également une chaîne de connexion csvsql créera le tableau et téléchargera le fichier en une seule fois :

$ csvsql --db "$MY_DB_URI" --insert myfile.csv

Il existe également des options pour spécifier la version de SQL et CSV avec laquelle vous travaillez. Ils sont documentés dans l'aide intégrée :

$ csvsql -h
usage: csvsql [-h] [-d DELIMITER] [-t] [-q QUOTECHAR] [-u {0,1,2,3}] [-b]
              [-p ESCAPECHAR] [-z MAXFIELDSIZE] [-e ENCODING] [-S] [-H] [-v]
              [--zero] [-y SNIFFLIMIT]
              [-i {access,sybase,sqlite,informix,firebird,mysql,oracle,maxdb,postgresql,mssql}]
              [--db CONNECTION_STRING] [--query QUERY] [--insert]
              [--tables TABLE_NAMES] [--no-constraints] [--no-create]
              [--blanks] [--no-inference] [--db-schema DB_SCHEMA]
              [FILE [FILE ...]]

Generate SQL statements for one or more CSV files, create execute those
statements directly on a database, and execute one or more SQL queries.
positional arguments:
  FILE                  The CSV file(s) to operate on. If omitted, will accept
                        input on STDIN.

optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -d DELIMITER, --delimiter DELIMITER
                        Delimiting character of the input CSV file.
  -t, --tabs            Specifies that the input CSV file is delimited with
                        tabs. Overrides "-d".
  -q QUOTECHAR, --quotechar QUOTECHAR
                        Character used to quote strings in the input CSV file.
  -u {0,1,2,3}, --quoting {0,1,2,3}
                        Quoting style used in the input CSV file. 0 = Quote
                        Minimal, 1 = Quote All, 2 = Quote Non-numeric, 3 =
                        Quote None.
  -b, --doublequote     Whether or not double quotes are doubled in the input
                        CSV file.
  -p ESCAPECHAR, --escapechar ESCAPECHAR
                        Character used to escape the delimiter if --quoting 3
                        ("Quote None") is specified and to escape the
                        QUOTECHAR if --doublequote is not specified.
  -z MAXFIELDSIZE, --maxfieldsize MAXFIELDSIZE
                        Maximum length of a single field in the input CSV
                        file.
  -e ENCODING, --encoding ENCODING
                        Specify the encoding the input CSV file.
  -S, --skipinitialspace
                        Ignore whitespace immediately following the delimiter.
  -H, --no-header-row   Specifies that the input CSV file has no header row.
                        Will create default headers.
  -v, --verbose         Print detailed tracebacks when errors occur.
  --zero                When interpreting or displaying column numbers, use
                        zero-based numbering instead of the default 1-based
                        numbering.
  -y SNIFFLIMIT, --snifflimit SNIFFLIMIT
                        Limit CSV dialect sniffing to the specified number of
                        bytes. Specify "0" to disable sniffing entirely.
  -i {access,sybase,sqlite,informix,firebird,mysql,oracle,maxdb,postgresql,mssql}, --dialect {access,sybase,sqlite,informix,firebird,mysql,oracle,maxdb,postgresql,mssql}
                        Dialect of SQL to generate. Only valid when --db is
                        not specified.
  --db CONNECTION_STRING
                        If present, a sqlalchemy connection string to use to
                        directly execute generated SQL on a database.
  --query QUERY         Execute one or more SQL queries delimited by ";" and
                        output the result of the last query as CSV.
  --insert              In addition to creating the table, also insert the
                        data into the table. Only valid when --db is
                        specified.
  --tables TABLE_NAMES  Specify one or more names for the tables to be
                        created. If omitted, the filename (minus extension) or
                        "stdin" will be used.
  --no-constraints      Generate a schema without length limits or null
                        checks. Useful when sampling big tables.
  --no-create           Skip creating a table. Only valid when --insert is
                        specified.
  --blanks              Do not coerce empty strings to NULL values.
  --no-inference        Disable type inference when parsing the input.
  --db-schema DB_SCHEMA
                        Optional name of database schema to create table(s)
                        in.

Plusieurs autres outils font également de l'inférence de schéma, notamment :

  • Apache Spark
  • Pandas (Python)
  • Blaze (Python)
  • read.csv + votre package db préféré en R

Chacun d'entre eux a la fonctionnalité de lire un CSV (et d'autres formats) dans une structure de données tabulaire généralement appelée DataFrame ou similaire, en déduisant les types de colonnes dans le processus. Ils ont ensuite d'autres commandes pour écrire un schéma SQL équivalent ou télécharger le DataFrame directement dans une base de données spécifiée. Le choix de l'outil dépendra du volume de données, de la manière dont elles sont stockées, des idiosyncrasies de votre CSV, de la base de données cible et de la langue dans laquelle vous préférez travailler.