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Phpmyadmin se fige sur la requête, la base de données est trop grande ?

Je ferais une explication pour que vous puissiez voir ce que fait mysql. Cela donnerait une bonne indication du nombre de lignes utilisées.

EXPLAIN SELECT * FROM likes LEFT OUTER JOIN uploads on likes.upload_id = uploads.upload_id WHERE uploads.upload_id IS NULL

vous pouvez également utiliser un autre navigateur ou une autre session pour utiliser show processlist pour voir comment la requête est exécutée.