mySQL le fera lorsqu'il rencontrera un caractère non valide dans le jeu de caractères actuel.
Vous ne mentionnez pas l'outil que vous utilisez pour importer les données, mais vous devriez pouvoir spécifier un jeu de caractères lors de l'importation. Si ce jeu de caractères correspond à celui de la base de données, tout ira bien. Assurez-vous également que le fichier est réellement encodé dans ce jeu de caractères.
Si votre outil d'importation n'offre pas la possibilité de sélectionner le jeu de caractères, vous pouvez essayer phpMyAdmin qui fait.