Le rappel de findOne() est asynchrone, il est exécuté après avoir rendu le jade. L'exécution passe à "TrackSession" avant que la variable utilisateur n'obtienne une nouvelle valeur.
Vous devez mettre le var html =... à l'intérieur du rappel.
var user = null;
User.findOne({$and: [{"_id": advisorId}, {"role": "advisor"}]},{firstName:1,lastName:1, '_id':0}, function(err,userData,user) {
user = userData;
TrackSession.find({'advisor_id' : advisorId},fields,function(err, chatHistoryData) {
var jade = require('jade');
var html = jade.renderFile(appRoot+'/views/generatePDFHTML.jade', {'chatHistoryData': chatHistoryData,
'selectedOptions':selectedOptions,
'advisor':user,
'tableHeaders':tableHeaders
});
console.log(html); return false;
});
});