Comment autoriser le champ nul lors de la mise à jour dans Mongoose ?

Construisez votre update objet par programmation pour ne pas inclure 'contact.phone' lorsqu'il n'est pas fourni :

var update = {
    name : venue.name
};
if (venue.contact.formattedPhone) {
    update['contact.phone'] = venue.contact.formattedPhone;
}
Venue.update({_id : venue.id}, update, {upsert: true, safe:false}).exec();