Vous essayez actuellement de mettre à jour en fonction d'une chaîne, pas d'un ObjectId.
Assurez-vous d'initialiser un nouvel ObjectId à partir de la chaîne lors de la construction de votre requête :
mongoDB.getCollection("restaurants").updateOne(
new BasicDBObject("_id", new ObjectId("56110fe1f882142d842b2a63")),
new BasicDBObject("$set", new BasicDBObject("zipcode", "10462"))
);