L'utilisation du pilote contre .NET Core 2.0 est tout à fait possible. Vous devez simplement vous assurer que vous référencez l'assembly .NET Standard 1.5 fourni avec le package NuGet suivant :
https://www.nuget.org/packages/MongoDB.Driver
De plus, la nouvelle version 2.5 vient d'être publiée il y a quelques jours, ce qui fonctionne probablement mieux avec MongoDB 3.6.
Vous pouvez également lire ce didacticiel :http:// www.qappdesign.com/using-mongodb-with-net-core-webapi/