MongoDB n'a pas encore la capacité de réplication sélective.
N'hésitez pas à ouvrir un JIRA :https://jira.mongodb.org/secure/Dashboard. jsp il y en a probablement déjà un mais une recherche Google par moi ne peut pas le faire apparaître.
Bien sûr, une option ici, pour accélérer les choses, consiste à copier physiquement les données d'un emplacement à l'autre sans attendre que la réplication de MongoDB s'installe.
Comme @Stennie le mentionne, il s'agit en fait du JIRA pour la réplication sélective :https://jira.mongodb .org/browse/SERVER-1559
