Je ne pense pas que ce soit actuellement possible. Je pense que votre meilleur pari est d'utiliser le champ uniforme sans faire référence à l'index de l'élément. Toutes les valeurs du tableau seront alors écrites dans le fichier csv, et vous pourrez les reformater correctement après l'exportation.
mongoexport --db paul --collection team --type=csv --fields _id,official_name,common_name,country,championship,uniform --out "C:\path\to\outputFile\output.csv"