Peut-être devriez-vous utiliser "$set" dans votre requête de mise à jour comme ceci :
{$set: {"name": req.body.name}}, // Update
Plus d'informations dans la documentation
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Si cela ne fonctionne pas, c'est probablement parce qu'il n'y a pas de correspondance avec votre filtre.
Peut-être devriez-vous essayer de faire correspondre avec un ObjectId comme celui-ci :
var ObjectID = require('mongodb').ObjectID;
// In your request
{ "_id": ObjectID(req.body._id)}, // Filter
J'espère que ça aide.