Vous pouvez le faire avec le Query#maxTime
méthode.
Donc, dans votre cas, vous l'appelleriez :
MySet.find({}).maxTime(10000).exec(function(err, doc) { ... });
Vous pouvez confirmer qu'il définit correctement le maxTimeMS
en activant le débogage de Mongoose via mongoose.set('debug', true);
puis vous verrez la sortie de la console pour cette requête qui ressemble à :
Mongoose: myset.find({}) { maxTimeMS: 10000, safe: true, fields: {} }