Il n'existe aucune méthode pour supprimer une collection de mongoose, le mieux que vous puissiez faire est d'en supprimer le contenu :
Model.remove({}, function(err) {
console.log('collection removed')
});
Mais il existe un moyen d'accéder au pilote javascript natif mongodb, qui peut être utilisé pour cela
mongoose.connection.collections['collectionName'].drop( function(err) {
console.log('collection dropped');
});
Avertissement
Faites une sauvegarde avant d'essayer ceci au cas où quelque chose tournerait mal !