J'ai résolu le problème comme décrit ici :http://blog.netgloo.com/2015/07/09/spring-boot-communications-link-failure-with-mysql-and-hibernate/
, en ajoutant ces configurations dans le application.properties
fichier :
spring.datasource.tomcat.testWhileIdle = true
spring.datasource.tomcat.timeBetweenEvictionRunsMillis = 60000
spring.datasource.tomcat.validationQuery = SELECT 1