Je sais que vous avez probablement renoncé à une réponse mais...
Je pense que vous constaterez que la plupart du temps supplémentaire est chargé et compilé le script PHP. si votre application précédente était un module apache, il est précompilé et toujours chargé, probablement écrit en c donc très rapide par rapport à PHP.
Essayez d'utiliser un accélérateur php comme eaccelerator. qui utilise de la mémoire partagée et des scripts précompilés pour améliorer parfois considérablement les performances des applications PHP.
CC
