Vous devez utiliser une requête native pour utiliser des fonctions de base de données telles que json_contains :
@Query("select c from CaseMessage c where c.caseId=?1 and c.id not in(select cm.id from CaseMessage cm where json_contains(status, '{\"status\": \"delete\"}') and json_contains(status, '{\"user_id\": ?2}'))", nativeQuery = true)
List<CaseMessageResponse> getAllCaseMessages(long caseId, long userId);
ou avec l'annotation @NativeQuery
pour plus d'informations :
Différence entre requête, native requête, requête nommée et requête typée