Avec l'aide de la requête SQL et du jar modifié pour ajouter un peu de débogage, j'ai enfin trouvé d'où vient le problème :votre projet avec l'id 39554 a 2 instantanés actifs (1234385 et 1234386). Ce cas d'utilisation n'est pas géré comme cela ne devrait jamais arriver.
Comme ce projet n'a pas été analysé depuis le 11/06/2013, vous avez aussi des choix :
- Soit exécuter une nouvelle analyse dessus avant de procéder à la migration vers la version 5.0
- Soit supprimer l'un des 2 instantanés.