Sur MySQL, vous pouvez utiliser FIND_IN_SET :
ORDER BY FIND_IN_SET(id, '0,2,5,1,3')
Le moyen le plus portable de commander serait d'utiliser une expression CASE :
ORDER BY CASE id
WHEN 0 THEN 1
WHEN 2 THEN 2
WHEN 5 THEN 3
WHEN 1 THEN 4
WHEN 3 THEN 5
END