Vous n'allez pas perdre de données. Ce message d'erreur est spécifique au fait que vous essayez de voir le contenu de la table et que vous sélectionnez trop de lignes à la fois. Le nombre de colonnes dans le tableau multiplié par le nombre de lignes affichées doit être inférieur à la valeur définie pour max_input_vars dans votre php.ini. Par défaut, il est défini sur 1 000.
Lorsque vous travaillez avec votre code spécifique, vous ne devriez pas rencontrer cette erreur SAUF si vous essayez de faire la même chose - afficher plus de 1 000 "éléments" d'une requête renvoyée à un moment donné. Vous vous attendez vraiment à faire ça ? Si c'est le cas, soyez intelligent en paginant vos données et en utilisant LIMIT dans votre requête SQL.
Les données elles-mêmes sont sécurisées. La seule chose affectée est la capacité de PHP à récupérer et à produire.