Si vous vous connectez à MySQL en utilisant SSL, tout votre trafic entre votre client SSL et votre serveur sera crypté.
MYSQL_CLIENT_SSL est obsolète. Utiliser mysqli si vous avez besoin d'utiliser SSL,
$db = mysqli_init();
$db->ssl_set(null, null,'cacert.pem',NULL,NULL);
$db->real_connect('host','user','pass','db');