Oui absolument, il y a beaucoup de choses, vous devriez tester votre application extrêmement minutieusement :
- Les transactions peuvent se bloquer et doivent être répétées. C'est le cas (dans certaines circonstances) même avec une transaction validée automatiquement qui n'insère qu'une seule ligne.
- L'utilisation du disque augmentera presque certainement
- La charge d'E/S pendant les écritures augmentera presque certainement
- Le comportement de l'indexation va changer car InnoDB utilise des index clusterisés - cela peut être un effet bénéfique dans certains cas
- Votre stratégie de sauvegarde en sera affectée. Réfléchissez bien.
Le processus de migration lui-même devra être soigneusement planifié, car il prendra beaucoup de temps si vous avez beaucoup de données (pendant ce temps, les données seront soit en lecture seule, soit complètement indisponibles - vérifiez !)